Vector Contamination List

At PlantGDB, efforts are undertaken to identify and remove all contaminant DNA so that a clean dataset is made available to researchers. Here, we use the Vmatch program (with options -l 50 -identity 90) to screen EST sequences against UniVec for vector contaminations as well as against E. coli genomes for bacterial sequences contaminations. The table lists the individual contaminated sequence. (Return to Vector Contamination menu)



Skip to page: 1 2 3 4 5
Sequence ID Organism Sequence Type Contamination Type
255779322Caryocar_brasilienseESTVector
255779323Caryocar_brasilienseESTVector
255779324Caryocar_brasilienseESTVector
255779325Caryocar_brasilienseESTVector
255779326Caryocar_brasilienseESTVector
255779327Caryocar_brasilienseESTVector
255779328Caryocar_brasilienseESTVector
255779329Caryocar_brasilienseESTVector
255779331Caryocar_brasilienseESTVector
255779332Caryocar_brasilienseESTVector
255779334Caryocar_brasilienseESTVector
260678623Caryocar_brasilienseESTVector
260678629Caryocar_brasilienseESTVector
260678630Caryocar_brasilienseESTVector
260678631Caryocar_brasilienseESTVector
260678634Caryocar_brasilienseESTVector
260678637Caryocar_brasilienseESTVector
260678638Caryocar_brasilienseESTVector
260678640Caryocar_brasilienseESTVector
260678642Caryocar_brasilienseESTVector
260678643Caryocar_brasilienseESTVector
260678646Caryocar_brasilienseESTVector
260678647Caryocar_brasilienseESTVector
260678648Caryocar_brasilienseESTVector
260678649Caryocar_brasilienseESTVector
260678650Caryocar_brasilienseESTVector
260678651Caryocar_brasilienseESTVector
260678652Caryocar_brasilienseESTVector
260678654Caryocar_brasilienseESTVector
260678656Caryocar_brasilienseESTVector
260678658Caryocar_brasilienseESTVector
260678660Caryocar_brasilienseESTVector
260678662Caryocar_brasilienseESTVector
260678664Caryocar_brasilienseESTVector
260678666Caryocar_brasilienseESTVector
260678668Caryocar_brasilienseESTVector
260678670Caryocar_brasilienseESTVector
260678674Caryocar_brasilienseESTVector
260678675Caryocar_brasilienseESTVector
260678677Caryocar_brasilienseESTVector
260678678Caryocar_brasilienseESTVector
260678680Caryocar_brasilienseESTVector
260678682Caryocar_brasilienseESTVector
260678685Caryocar_brasilienseESTVector
260678687Caryocar_brasilienseESTVector
260678689Caryocar_brasilienseESTVector
260678691Caryocar_brasilienseESTVector
260678694Caryocar_brasilienseESTVector
260678695Caryocar_brasilienseESTVector
260678698Caryocar_brasilienseESTVector
260678700Caryocar_brasilienseESTVector
260678702Caryocar_brasilienseESTVector
260678704Caryocar_brasilienseESTVector
260678706Caryocar_brasilienseESTVector
260678708Caryocar_brasilienseESTVector
260678709Caryocar_brasilienseESTVector
260678710Caryocar_brasilienseESTVector
260678711Caryocar_brasilienseESTVector
260678712Caryocar_brasilienseESTVector
260678713Caryocar_brasilienseESTVector
260678714Caryocar_brasilienseESTVector
260678715Caryocar_brasilienseESTVector
260678716Caryocar_brasilienseESTVector
260678717Caryocar_brasilienseESTVector
260678721Caryocar_brasilienseESTVector
260678723Caryocar_brasilienseESTVector
260678724Caryocar_brasilienseESTVector
260678726Caryocar_brasilienseESTVector
260678728Caryocar_brasilienseESTVector
260678730Caryocar_brasilienseESTVector
260678731Caryocar_brasilienseESTVector
260678732Caryocar_brasilienseESTVector
260678733Caryocar_brasilienseESTVector
260678736Caryocar_brasilienseESTVector
260678737Caryocar_brasilienseESTVector
260678738Caryocar_brasilienseESTVector
260678739Caryocar_brasilienseESTVector
260678740Caryocar_brasilienseESTVector
260678741Caryocar_brasilienseESTVector
260678742Caryocar_brasilienseESTVector
260678743Caryocar_brasilienseESTVector
260678746Caryocar_brasilienseESTVector
260678748Caryocar_brasilienseESTVector
260678749Caryocar_brasilienseESTVector
260678750Caryocar_brasilienseESTVector
260678751Caryocar_brasilienseESTVector
260678752Caryocar_brasilienseESTVector
260678753Caryocar_brasilienseESTVector
260678754Caryocar_brasilienseESTVector
260678755Caryocar_brasilienseESTVector
260678760Caryocar_brasilienseESTVector
260678761Caryocar_brasilienseESTVector
260678763Caryocar_brasilienseESTVector
260678764Caryocar_brasilienseESTVector
260678766Caryocar_brasilienseESTVector
260678767Caryocar_brasilienseESTVector
260678771Caryocar_brasilienseESTVector
260678772Caryocar_brasilienseESTVector
260678773Caryocar_brasilienseESTVector
260678775Caryocar_brasilienseESTVector

Loading Help Page...Thanks for your patience!

Loading Video...Thanks for your patience!

Loading Image...Thanks for your patience!