Vector Contamination List

At PlantGDB, efforts are undertaken to identify and remove all contaminant DNA so that a clean dataset is made available to researchers. Here, we use the Vmatch program (with options -l 50 -identity 90) to screen EST sequences against UniVec for vector contaminations as well as against E. coli genomes for bacterial sequences contaminations. The table lists the individual contaminated sequence. (Return to Vector Contamination menu)



Skip to page: 1 2 3
Sequence ID Organism Sequence Type Contamination Type
3413991Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414012Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414014Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414025Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414157Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414160Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414163Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414177Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414226Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414272Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414284Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414287Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414323Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414327Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414329Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414333Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414336Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414355Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414390Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414399Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414421Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414440Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414450Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414458Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414460Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
3414483Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
5056179Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
5724929Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156789344Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156789430Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156789527Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156789581Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156789647Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156789660Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156789818Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156789820Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156789836Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156790104Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156790150Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156790291Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156790420Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156790854Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156796681Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156797233Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156797764Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156798473Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156799428Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156800231Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156800367Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156802049Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156802480Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156804046Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156805853Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156807753Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156807989Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156808996Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156809511Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156824302Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156829057Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156829064Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156829070Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156829071Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156829081Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156829095Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156829099Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156829106Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156829109Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156829117Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156851711Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156853746Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156874882Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156878024Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156881718Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156881766Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156881890Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156881993Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
20374020Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
20374065Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
20374082Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
20374938Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
20375034Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
179828466Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
179829334Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
179828784Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
179829112Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
53849690Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
53849712Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
53849723Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
53849728Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
53849734Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
54417842Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
54418176Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
54418934Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
54419376Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
54421614Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156940380Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156940467Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156940475Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156940536Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector
156940755Brassica_rapa_subsp__pekinensisESTVector

Loading Help Page...Thanks for your patience!

Loading Video...Thanks for your patience!

Loading Image...Thanks for your patience!